华大基因开发基因融合检测算法 将助力肿瘤研究和新药开发

发布时间:2013-02-27来源:深圳特区报编辑:郑创彬

  深圳新闻网讯 日前,华大基因成功开发出一种基因融合检测算法SOAPfuse。该算法具有准确率高、敏感性强、精度高、资源消耗少等优点,可以对基因融合进行快速、精确的检测。最新研究成果本月14日在《Genome Biology》杂志上在线发表。

  据介绍,基因融合是指染色体上两个异位的基因嵌合在一起,形成了一个嵌合基因,在癌症的发生上扮演着重要的角色,并可作为诊断和治疗癌症的靶标。和已有的算法相比,SOAPfuse具有更高的灵敏度和特异性,并且可以大大减少资源消耗。此外,该算法还有融合断点预测和可视化功能,这些都能极大提高基因融合的检测效率,对于推动疾病尤其是肿瘤的研究和肿瘤新药的开发具有重要意义。目前,SOAPfuse已免费对外公开,可在网上在线下载。(记者 杨婧如 通讯员张钫刘佳)